Nel 1546 fu fondata la città di Arica in un luogo chiamato El Chenchorro. Cinquant'anni dopo la città fu devastata da un terremoto e dallo tsunami, che ha costretto i residenti di spostare le loro case in porto sotto la protezione di Capo Morro, nel luogo dove si trova ora.

L'attuale costruzione della Cattedrale di Arica è stata costruita sulle rovine del secondo tempio della città, che è stato costruito nel 1640. Dopo 200 anni di servizio, la chiesa fu distrutta da un terremoto nel 1868. Solo conservato gradini di pietra. Il progetto della nuova chiesa è stata ordinata dal presidente peruviano Jose Balta nello studio francese di Gustave Eiffel, ed è stato originariamente previsto per la stazione di Ancon. Ma nel 1875 si è deciso di costruire in Arica. Un anno dopo, il tempio si è tenuta la prima Messa.

Durante la Guerra del Pacifico (1879-1883) ha iniziato a far parte della città di Arica in Cile. Ma fino a quando l'arrivo del XX secolo, Arica rimase sotto la guida della Diocesi di Arequipa, secondo il decreto del Vaticano. Nel 1910, il sindaco della città di Arica, Maximo Lira, ha decretato l'espulsione del sacerdote peruviano e il suo assistente dal paese. Essi sono stati sostituiti da cappellani militari cileni.

Nel 1911 la chiesa era annessa alla diocesi di Tarapaca (ora - la diocesi di Iquique). E nel 1959 è stato trasferito al rango di cattedrale. Con la benedizione di Papa Giovanni Paolo II nel 1986, fu fondata dalla Diocesi di Arica al centro della città, nella cattedrale di San Marco a Arica.

La chiesa è relativamente piccolo, in stile gotico. Il progetto della chiesa è interamente in metallo - travi, colonne, collegati da archi a sesto acuto, ad eccezione di due porte in legno. La torre del tempio si alza verso il cielo, dando la bellezza e la grandezza della struttura, che si arricchisce di paesaggio circostante: Plaza de Colón, Capo Morro de Arica, il porto, il porto e il mare sconfinato.

Nel 1984 la costruzione della Cattedrale dichiarata monumento nazionale del Cile. E nel 2002 - il monumento storico di Arica.